și modalitățile prin care se răspândește infecția pot fi diferite. Colonizarea mediată de agenți patogeni poate avea loc de fapt prin:
- Calea ascendentă de la vezică (cea mai frecventă): de la perineu (sau de la vestibulul vaginal, în cazul femeilor), microorganismele urcă în uretra, apoi în vezică, până la rinichi; principalele cauze de infecție la femei constă în deformarea uretrei în timpul actului sexual, în timp ce la bărbați este adesea secundară prostatitei. La pacienții cateterizați, contaminarea poate apărea după poziționarea sau manipularea cateterului, cu consecința posibilă ascensiune a agenților patogeni în vezică .
- Calea descendentă a sângelui: prin fluxul sanguin, în cursul septicemiei, agenții patogeni ajung la rinichi provocând nefrită și abcese renale.
- Calea limfatică descendentă: o rețea de vase limfatice conectează colonul ascendent cu rinichiul drept și colonul descendent cu rinichiul stâng.
Microorganismele implicate în pielonefrita sunt de obicei aceleași responsabile pentru infecțiile tractului urinar, ale tractului genital și gastro-intestinal, deci în vezică, prostată, col uterin, vagin, uretra sau rect: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. etc.
În majoritatea cazurilor, acești agenți patogeni reprezintă bacteriile florei fecale, care iau calea ascendentă deși în general peristaltismul (mișcări de contracții și distensie a pereților căilor urinare) desfășoară o „acțiune eficientă de protecție împotriva infecțiilor.
Alte microorganisme neobișnuite sunt raportate ocazional: micobacterii, drojdii și ciuperci, precum și agenți patogeni oportunisti precum Corynebacterium urealyticum.